Agathonisi (greco: αθονήσι) (Gaidaro) è un greco isola nel Mar Egeo.
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Ci sono tre città sull'isola di Agathonisi: la città portuale di Agios Georgios e due città più piccole chiamate Megalo Chorió e Mikró Chorió.
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In barca
Un traghetto trisettimanale da Pythagoreio in poi Samos impiega poco più di un'ora ed è l'unico metodo di arrivo ad Agathonisi.